Free ntsyspc 2.1 download software at UpdateStar. (2000) NTSYS-Pc: Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System. Version 2.1., Exeter Publishing Led., New York. Has been cited by the following article: TITLE: Genetic Diversity and Population Structure of North China Mountain Walnut Revealed by ISSR.
Article citations Rohlf, F.J. (2000) NTSYS-Pc: Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System. Version 2.1., Exeter Publishing Led., New York. Has been cited by the following article:. TITLE: AUTHORS:, KEYWORDS:, JOURNAL NAME:, October 24, 2014 ABSTRACT: North China Mountain Walnut (NCMW) is one of the ancestors of extant cultivated species, and a valuable gene resource for resistance breeding of walnut in China. Inter-Simple Sequence Repeat (ISSR) primers were designed to evaluate the level and pattern of genetic diversity in eight populations of NCMW. Nine ISSR primers yielded 91 amplification products with different sizes, of which 84 (92.31%) were polymorphic.
A high species-level genetic diversity was detected with Nei’s (H = 0.2592) and Shannon’s diversity (I = 0.4003). In contrast, the population-level genetic diversity was relatively lower (PPB = 43.27%, H = 0.1347, I = 0.1862). Coefficient of populations differentiation (GST) was 0.5066, indicating that inter-population and intra-population variation contributed 50.66% and 49.34% respectively to the total genetic variability. This relative level of variation was further supported by AMOVA analysis.
Limited gene flow (Nm = 0.5133.), habitat fragmentation and geographical isolation might be responsible for the population structure of NCMW. UPGMA cluster analysis classified the eight populations into three groups which showed no significant relationship between the genetic similarity coefficient and geographic origin but showed remarkable association with morpho-physiological characters, particularly nut traits.
The results of the study provide species-level and population-level genetic profiles for further exploitation and conservation of genetic diversity of NCMW.
NTsys یک نرم افزار بسیار قدرتمند جهت انجام چندین آزمون آماری چند متغیره نظیر تجزیه به مؤلفه های اصلی، Correspondence analysis، تجزیه همبستگی های کانونی و چند آزمون آماری چند متغیره دیگر می باشد. با این وجود مهم ترین بخش این نرم افزار تجزیه خوشه ای یا Cluster analysis است که بطور منحصر به فردی گسترش یافته است. در این نرم افزار شما می توانید با استفاده از انواع ضرائب فاصله، دندروگرام (درخت تجزیه) ژنوتیپ های مورد آزمون را با روش های مختلف تجزیه خوشه ای نظیر UPGMAT، CL و غیره رسم کنید. همچنین نمودار رسم شده کاملاً قابل ویرایش است. نکته کلیدی این نرم افزار دارا بودن ضرائب فاصله متعدد و مختلف نظیر ضریب نی-لی می باشد که برای گروه بندی ژنوتیپ هایی که نواربندی آن ها پس از الکتروفورز بر روی ژل قرائت می گردند مناسب است (داده های 0 و 1). این نرم افزار کاربرد زیادی دارد و هم اکنون در دانشگاه های تهران و تربیت مدرس تدریس می شود.
قابلیت های کلیدی NTsys: - انجام چندین آزمون آماری چند متغیره نظیر تجزیه به مؤلفه های اصلی، Correspondence analysis، تجزیه همبستگی های کانونی و چند آزمون آماری چند متغیره دیگر - تجزیه خوشه ای یا Cluster analysis - اان استفاده از انواع ضرائب فاصله، دندروگرام (درخت تجزیه) برای رسم ژنوتیپ های مورد آزمون، با روش های مختلف تجزیه خوشه ای نظیر UPGMAT، CL و غیره - امکان ویرایش نمودار رسم شده - دارا بودن ضرائب فاصله متعدد و مختلف نظیر ضریب نی-لی - و. نکات: 1- نرم افزار اجرا و تست شده است و مشکلی ندارد. 2- نرم افزار نیازی به نصب ندارد و تنها با اجرای فایل ntsys.exe اجرا می شود. 3- سریال لازم برای رجیستر کردن برنامه در فایل Serial.txt آمده است. 4- برای رجیستر کردن می توانید هر نامی را وارد کنید. 5- این نرم افزار با نام NTsys نیز منتشر شده است. NTSYSpc can be used to discover pattern and structure in multivariate data.
For example, one may wish to discover that a sample of data points suggests that the samples may have come from two or more distinct populations or to estimate a phylogenetic tree using the neighbor-joining or UPGMA methods for constructing dendrograms. Of equal interest is the discovery that the variation in some subsets of variables are highly inter-correlated (clustered).
The program originated as NTSYS in the 1960s but over the years is has been completely redesigned and greatly extended for use on PCs. The input can be descriptive information about collections of objects or directly measured similarities or dissimilarities between all pairs of objects. The kinds of descriptors and objects used depend upon the application—morphological characters, abundances of species, presence and absence of properties, etc. NTSYSpc can transform data, estimate dis/similarities among objects, and prepare summaries of the relationships using cluster analysis, ordination, and multiple factor analyses. Many of the results can be shown both numerically and graphically. The software is designed for both classroom and research. Version for Windows is easy to use yet still has the speed and functionality of the previous versions.
There is an interactive mode (with “fill-in-the-blanks” entry forms) and a batch mode with a simple command language (useful for analysis of simulations and multiple datasets). The program takes advantage of the Windows environment and allows long file names and the processing of large datasets. Plot options windows allows you to customize the plots (specify titles, fonts, sizes, colors, scales, line widths, background colors, margins, and many other aspects of what is plotted). There is also a print preview mode. NTS data files are ASCII files that can be shared with other programs. Long input lines are supported. A spreadsheet-like data editor is included that makes it easy to create and edit data files.
It can be also used as an ASCII text editor for very large files. Matrices can be read from Excel XLS and CSV files and trees can be read from one type of nexus files. An option is provided to output to MATLAB M files. Here are some key features of 'NTSYSpc': - Similarity and dissimilarity: correlation, distance, 34 association - coefficients, and 11 coefficients. Clustering: UPGMA and other hierarchical SAHN methods (allows for ties). Neighborjoining method (including the new unweighted version). Several types of consensus trees.
methods: minimumlength spanning trees. Graphs (unrooted trees) from the neighborjoining method. Ordination: principal components & principal coordinates analysis, correspondence analysis, metric & nonmetric multidimensional scaling analysis, singularvalue decompositions, projections onto axes and Burnaby's method.
Canonical variates analysis. Programs for multiple factor analysis, common principal components analysis, partial leastsquares, multiple correlation, and canonical correlations are also included. Interactive graphics: phenograms, phylogenetic trees, 2D scatter plots, comparison of dis/similarity matrices, Fourier plots of outlines, Procrustes plots, and 3-D perspective plots. Multivariate tests: canonical variates analysis, tests for homogeneity of covariance matrices, tests for number of dimensions, generalized multivariate multiple regression analysis. There are also provisions for bootstrap, jackknife, and simulation experiments. Geometric morphometrics: includes specialized modules for Procrustes analysis to superimpose landmark configurations, plotting the results of a Procrustes analysis, Fourier analysis (including 2D and 3D elliptic) of outline shapes, plotting outlines and Fourier coefficients, and computation of 2D and 3D partial warp scores and estimates of the uniform component. Other: includes comparison of matrices by cophenetic correlation, Mantel test, 3-way Mantel test, data standardization, and matrix transformations (simple functions, deletion, and now matrix transpose).
Matrices can be split or combined. راهنمای دانلود. اگر نرم افزار مدیریت دانلود ندارید، قبل از دانلود هرگونه فایلی، یک نرم افزار مدیریت دانلود مانند و یا نصب کنید. برای دانلود، به روی عبارت 'دانلود' کلیک کنید و منتظر بمانید تا پنجره مربوطه ظاهر شود سپس محل ذخیره شدن فایل را انتخاب کنید و منتظر بمانید تا دانلود تمام شود.
در صورت بروز مشکل در دانلود فایل ها تنها کافی است در آخر لینک دانلود فایل یک علامت سوال? قرار دهید تا فایل به راحتی دانلود شود. فایل های قرار داده شده برای دانلود به منظور کاهش حجم و دریافت سریعتر فشرده شده اند، برای خارج سازی فایل ها از حالت فشرده از نرم افزار و یا مشابه آن استفاده کنید. چنانچه در مقابل لینک دانلود عبارت بخش اول، دوم و.
مشاهده کردید تمام بخش ها می بایستی حتماً دانلود شود تا فایل قابل استفاده باشد. کلمه رمز جهت بازگشایی فایل فشرده عبارت www.p30download.com می باشد. تمامی حروف را می بایستی به صورت کوچک تایپ کنید و در هنگام تایپ به وضعیت EN/FA کیبورد خود توجه داشته باشید همچنین بهتر است کلمه رمز را تایپ کنید و از Copy-Paste آن بپرهیزید. چنانچه در هنگام خارج سازی فایل از حالت فشرده با پیغام CRC مواجه شدید، در صورتی که کلمه رمز را درست وارد کرده باشید. فایل به صورت خراب دانلود شده است و می بایستی مجدداً آن را دانلود کنید. فایل های کرک به دلیل ماهیت عملکرد در هنگام استفاده ممکن است توسط آنتی ویروس ها به عنوان فایل خطرناک شناسایی شوند در این گونه مواقع به صورت موقت آنتی ویروس خود را غیر فعال کنید. فیلم راهنمای دانلود و رفع عیب فایل های دانلود شده را در ببینید.